集團自2013年開始組建高通量測序平臺，嚴格按照國家衛計委對高通量測序實驗室的要求進行規范。該平臺定位于科研與臨床公共服務應用，與合同單位開放共享。2014年11月由南方醫科大學與廣州華銀醫學檢驗中心有限公司共同成立南方醫科大學生物醫學大數據研究中心（Bio Med Big Data Center, BMDC），該中心是專注于生物醫學大數據的信息采集、研究分析、提取整合、應用轉化的公共服務平臺。BMDC緊密依托南方醫科大學的大規模模式生物、微生物中心和臨床資源集成的生物學平臺，以及集團先進的高通量測序技術平臺。在丁彥青、徐湘民、張鎮海、張文清、李金明、周宏偉等權威專家的帶領下，匯聚了全國高通量測序及生物信息分析資深研究學者，形成了覆蓋醫學遺傳學、病理學、臨床醫學、模式生物學、微生物學、生物信息學、衛生統計學等眾多領域的強大專家團隊。
新一代測序技術幫助眾多科研人員取得了舉世矚目的研究成果，而隨之產生的海量數據使眾多研究者面臨考驗。基于二代測序的生物醫學大數據研究中心，致力于突破二代測序所面臨的數據分析等挑戰。BMDC圍繞地中海貧血和白血病、出生缺陷性疾病、慢性腎病和肝炎、神經性疾病、大腸癌、消化系統疾病，對超大人群體檢樣本庫進行易感基因、分子標記物篩查、大規模遺傳學生物突變體篩選等研究，以進一步研究發病機制、風險預警、早期診斷和干預、治療策略。
